办理建筑工程施工总承包三级资质要经过以下流程：
第一步，准备营业执照：申请资质前，建筑企业必须有营业执照。
第二步，根据申请的资质标准配备专业人员，同时要考取相应的证件：准备申请资质等级相应的技术人员资料一级建造师、二级建造师、高级工程师、工程师、九大员、技术工人等。
第三步，提出申请：办理资质的企业要以法人名义向企业注册所在地的区县建设行政主管部门提出书面申请，区县建设行政主管部门同意后，上报地、州、市建设局，地、州、市建设行政部门审查合格并签署意见，报厅建筑管理处。
第四步，审核批准：市住房和城乡建设局对申请装修资质的企业进行审核，主要审核企业人员、企业资产、工程业绩是否符合资质标准。
第五步，上报：申请资质的企业按照属地管理的原则向所在区建筑业管理部门提交资质申请材料原件及复印件，区建筑业管理部门初审合格后报市建管处。
第六步，公示：建管处对资质申请材料进行审核，对属于市级核准范围的资质进行公示，公示完成后，无异议的予以核准并报省建管局备案。
第七步，领证：企业在资质核准后，到市住建局工程科办理建造师注册手续，待领取注册建造师证书后，再领取资质证书。
